Изпълнителна агенция „Програма за образование“ изпълнява функциите на управляващ орган на ОП "Наука и образование за интелигентен растеж" 2014 – 2020 и Програма „Образование“ 2021-2027. Агенцията отговаря за цялостното програмиране, управление и изпълнение на програмите.
На ИАПО, със заповед на министъра на образованието и науката, са възложени функциите на екип за изпълнение на четирите инвестиции по стълб 1 „Иновативна България“ на Националния план за възстановяване и устойчивост: „Центрове за НТИМ и иновации в образованието“, „Модернизиране на образователна инфраструктура“, „Младежки центрове“ и „Програма за ускоряване на икономическото възстановяване и трансформация чрез наука и иновации“ в Структурата за наблюдение и докладване в МОН.